东北农业大学有1个校区，东北农业大学本部。
东北农业大学是一所“以农科为优势，以生命科学和食品科学为特色，农、工、理、经、管等多学科协调发展”的国家“211工程”重点建设大学，是黑龙江省人民政府与农业部省部共建大学、国家“中西部高校基础能力建设工程”项目入选高校、教育部本科教学工作水平评估优秀院校。1981年被确定为黑龙江省省属重点院校，1994年与黑龙江省农业管理干部学院合并组建东北农业大学。
东北农业大学本部：
黑龙江省哈尔滨市香坊区木材街59号。截至8月，学校占地面积496.4万平方米，总建筑面积117.4万平方米，教学科研仪器设备总值4.8亿元。设有17个学院和1个教学部，开办71个本科专业。有专任教师1 544人，其中教授312人、副教授452人;具有博士学位者712人，具有硕士学位者557人。
院系设置
| 农学院 | 经济管理学院 | 工程学院 |
| 动物科学技术学院 | 动物医学学院 | 食品学院 |
| 生命科学学院 | 园艺学院 | 资源与环境学院 |
| 水利与建筑学院 | 应用技术学院 | 文法学院 |
| 理学院 | 国际文化教育学院 | 电气与信息学院 |
| 艺术学院（艺术教育中心） | 体育部 | 马克思主义学院 |
| 成栋学院 |
