上述科研处处长介绍，“985工程”和“211工程”都是国家通过经费投入支持高校建设的重点项目。其中，“211工程”侧重以学科为重点支持，目前，有112所高校入围;而列入“985工程”的高校数量较少，目前共39所，资金使用更为密集，以能力建设为重点，希望整体提升入围高校的办学实力。
他认为，即便网上传闻成真，乃至未来，国家启动新的“985后”高校建设项目，都是正常的。例如，为落实胡锦涛在清华百年校庆讲话精神，教育部、财政部决定启动实施的“2011计划”(高等学校创新能力提升计划)就是另一种国家重点项目，意在通过打破现有学科、行政格局局限，在关键领域上通过协同创新取得突破。
由于“985工程”和“211工程”高校已暂停“招新”，有业内人士向新京报记者透露，当前，没被纳入“985工程”和“211工程”的高校，就希望能在“2011计划”协同创新平台申报上取得突破。但上述教育部官员表示，“985工程”和“211工程”重点是投资高校整体，但“2011计划”主要投资的是协同创新平台，范围显得小得多。
该官员认为，根据党的十八届三中全会中关于深化教育领域综合改革的决定精神，未来，教育部将逐渐减少专项经费拨款，以增强高校的办学自主权。
另一名要求匿名的985工程高校内部人士也透露，在学习已有清华大学、北京大学综合改革方案的过程中也发现，有高校已提出，希望国家将“985”“211”等类似高校建设项目经费转为日常拨款，由高校自行统筹划分，算是政府在高校拨款改革上放权给高校的尝试。
