补充医疗保险是国家给予政策支持的一种员工保障福利，对内它可以解决员工医疗负担，对外可以提高企业在人才竞争中的吸引力，目前已经成为多数企业的一项常规福利。国家要求补充医疗保险在单位自管的基础上，为了扩大资金的共济能力，鼓励中小企业实行统筹或委托商业保险公司进行管理。然而在政策执行过程中，补充医疗保险是否应该计缴个税，又该如何计缴个税成为一个困扰不少企业财务人员的问题。本文根据现实中不同企业的不同处理方法，对补充医疗保险进行涉税风险分析。
一、企业对补充医疗保险的相关处理
企业为员工购买的补充医疗保险，不同的企业处理方式不同，主要分以下两种：一种是委托商业保险公司进行管理，作为个人收入的一部分；一种是由企业自行统筹管理，职工发生重大疾病，持医院相关收费单据来企业进行报销。
二、法律法规的相关规定
根据《财政部国家税务总局关于基本养老保险费基本医疗保险费失业保险费住房公积金有关个人所得税政策的通知
各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局）、国家税务局、地方税务局，财政部驻各省、自治区、直辖市、计划单列市财政监察专员办事处，新疆生产建设兵团财务局：
根据上述文件规定，企事业单位按照国家或省级人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费和住房公积金，免征个人所得税。在该文件的免税项目中，不包括补充医疗保险，所以，企业为职工支付的补充医疗保险应当征收个人所得税。
三、实际操作中存在的问题
企业为职工个人购买商业性补充医疗保险等，在办理投保手续时应作为个人所得税的工资、薪金所得项目，按税法规定缴纳个人所得税。个人所得税的具体纳税时间应当按照《国家税务总局关于单位为员工支付有关保险缴纳个人所得税问题的批复》（国税函[2005]318号）规定，对企业为员工支付各项免税之外的保险金，应当在企业向保险公司缴付时并人员工当期的工资收入，按工资、薪金所得项目计征个人所得税，税款由企业负责代扣代缴。
根据财税[2006]10号文件的规定；企业为职工支付的补充医疗保险金不属于免税项目，应当征收个人所得税。根据目前的普遍做法，各地社会保险基金管理中心并不负责补充医疗基金的管理，通常做法是企业委托商业保险公司代为管理或由企业自行管理。如果企业将补充医疗保险委托商业性保险公司管理，则应当在保险公司落到被保险人的保险账户时代扣代缴个人所得税。
企业自行管理模式通常用于支付职工和退休人员在定点医疗机构和定点零售药店发生的费用，包括个人账户不足支付的医疗费用、基本医疗保险统筹基金支付之余应由个人支付的医疗费用以及大额医疗费用互助资金支付之余应由个人支付的医疗费用。补充医疗保险由企业管理。企业补充医疗保险费当年结余部分，结转下一年度使用。由于企业计提补充医疗保险时并没有落人个人账户，而且以后每位职工报销的医疗费用金额不等，这种管理模式就很难代扣代缴个人所得税。
四、解决之道
如果按照税局的规定，对补充医疗保险计缴个税，则应做以下账务处理
（一）会计处理问题。
（1）对委托商业性保险公司进行管理的补充医疗保险
（2）对纳入企业统筹由企业自行管理的补充医疗保险的会计处理同委托商业性保险公司进行管理的补充医疗保险。
（二）纳税问题。
（1）对委托商业性保险公司进行管理的补充医疗保险，应在计提时按照计提数直接合并入当月工资薪金进行个人所得税的计缴；
（2）对纳入企业统筹由企业自行管理的补充医疗保险，应在职工拿医院有效收费单据报销的当月，按实际报销金额合并入当月工资薪金进行个人所得税的计缴。
总结
对于委托商业保险公司进行管理的补充医疗保险，这笔钱最终属于职工，所以纳入各月工资薪金进行缴纳无疑；而对于纳入企业统筹由企业自行管理的补充医疗保险，因为职工并非直接接受到了这笔收入，故要求全部计入当月工资薪金进行计缴个税略显不公平，然而按照实报实销的金额合并进入当月工资薪金进行计缴个税难免存在税务风险，所以作者认为，是否可以考虑将纳入企业统筹方式的补充医疗保险，计入应付职工福利费，而非计入应付职工薪酬，以此方式来合理的避免这部分的金额计缴个税。
