我校是全国唯一一所以继承、挖掘、提高和弘扬维吾尔医药学为宗旨，以培养维吾尔医医药高素质专业技术人才为目标的全日制普通专科学校。1984年，在内蒙古呼和浩特召开的全国第二次民族医药工作会议提议成立新疆维吾尔医学专科学校。同年九月，经自治区人民政府批准，1985年开始筹建，1987年起招生，1989年经教育部（原国家教委）正式批准成立。学校的成立实现了维吾尔医医药学教育从传统的师带徒方式向正规化现代高等教育方式的转变，在维吾尔医药学教育发展史上揭开了新的篇章。2006年底和田卫校整建制并入我校。2011年9月学校从卫生厅归口至教育厅管理。学校现隶属于自治区教育厅，受自治区教育厅及和田地区行署双重管理。
2、目前办学条件
办学规模学校现有全日制在校生4779人，其中全日制大专生1589人，全日制中专生3190人。
学科与专业学校专科层次现有维医学、维药学、护理学、医学检验技术、康复治疗技术等5个高职专业，其中维医学专业是自治区级特色专业，医学检验技术专业是自治区级重点专业。中等职业教育层次现有乡村医师、护理、妇幼保健、药剂、助产士、检验技术、影像等7个中职专业。
2005年，与江西中医学院联合开办中医学维医方向、维药方向两个普通本科（方向）专业。
成人教育专科层次开设有维医学、维药学专业，与新疆医科大学继续教育学院联合开办本、专科层次西医临床、护理学专业和本科层次维医学、维药学专业。目前正在与安徽中医药大学、西安交通大学医学院磋商联合办学事宜，争取年内实现成人教育的联合办学。
师资队伍全校编制总数260人，在编教职工有240人，专任教师123人，生师比为37.2:1。在专任教师中，具有副高以上专业技术职务的50人（其中正高7人，副高43人），占专任教师总数的40.65%；具有硕士以上学位的10人（其中博士1人、硕士9人），占专任教师总数的8.13%。有维医内科学教学团队1个自治区级优秀教学团队。
此外，学校积极争取对口支援，现有安徽省教育厅、北京中医药大学、上海同济大学、西安交通大学和安徽中医药大学等四所高等院校的5名副高以上职称的教师和行政管理干部在我校参与教学科研工作。同时还聘请了复旦大学、新疆医科大学、和田地区名老维医以及全疆各大维吾尔医医院的20余名专家、学者担任学校的名誉教授。
教学、科研工作坚持以教师为本、以学生为本，不断强化教学中心地位，着力深化教育教学改革，狠抓内涵建设，不断提高人才培养质量。高度重视构建校企结合、工学结合的人才培养模式，维医学专业形成“理实一体能力递进”人才培养模式，维药学形成了“一链、三段、五模块”人才培养模式。近年来，建成了《维医内科学》、《维医生药学》2门自治区级精品课程。学校在2009年顺利通过教育部人才培养水平评估。
学校承担国家级、自治区级科研课题共19项，其中“爱维心口服液临床作用与产业化研究”课题于2009年荣获自治区科技进步奖。
为了更好地做好科学研究工作，学校成立了维医药研究所、维医药职业教育研究所和维医药文献研究所，积极争取承担国家级、自治区级科研课题。同时为了更好地打造学术研究交流平台，学校创办维医药学学术性刊物《新疆维吾尔医学专科学校学报》23年，共出版105期。
2010年维医药被定为国家级非物质文化遗产，学校被定为非物质文化遗产保护单位。整理、出版10余部古籍文献。编写出版了26种教材，形成了维吾尔医医、药学大专第二版教材体系，现与新疆医科大学合作编写维吾尔医医、药学本科教材。
基础设施
占地总面积：1756000平方米（合2634亩），生均382.9平方米。其中，主校区100亩、分校区24亩，新校区1000亩，药材基地1280亩，直属医院30亩，直属药厂200亩。
建筑面积：校舍建筑面积89540平方米，其中教学行政用房26366平方米，生均5.75平方米。
教学仪器设备值：教学仪器设备总值2401.66万元，生均5236.93元。
图书资料：馆藏适用纸质图书10.18万册，生均22.19册。同时建有现代电子图书系统和计算机网络服务体系。
实习、实训场所：建有12个基础实验室、直属医院、药厂、制剂室、药材种植基地等校内实训基地（其中生物制药实训基地被定为中央财政支持的示范性实训基地建设项目）。同时还与全疆30余家各级各类维吾尔医院、药厂等签约挂牌，构筑了校外实习、实训基地。
