南京大学有2个校区，分别是鼓楼校区、仙林校区
南京大学坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的金陵古都，是一所历史悠久、声誉卓著的百年名校。其前身是创建于1902年的三江师范学堂，此后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、第四中山大学、国立中央大学、国立南京大学等历史时期，于1950年更名为南京大学。在一个多世纪的办学历程中，南京大学及其前身与时代同呼吸、与民族共命运，谋国家之强盛、求科学之进步，为国家的富强和民族的振兴做出了重要的贡献。尤其是改革开放以来，作为教育部直属的重点综合性大学，南京大学又在崭新的历史机遇中焕发出新的生机，在教学、科研和社会服务等各个领域保持良好的发展态势，各项办学指标和综合实力均位居全国高校前列。。
南京大学鼓楼校区
地址：南京市鼓楼区汉口路22号。邮编：210093。
南京大学鼓楼校区为南京大学三大校区之一，全国重点文物保护单位金陵大学旧址所在地。1952年南京大学由四牌楼迁往鼓楼办学，鼓楼校区也成为南京大学主校区，直至南京大学仙林校区启用。
南京大学仙林校区
地址：南京市栖霞区仙林大道163号。邮编：210023。
校区建设得到大量社会捐赠，几乎每幢楼每个建设项目都有校友、政府援建。仙林校区2009年9月投入使用，2012年成为南京大学主校区。2012年，国际小行星命名委员会批准国际编号为187707的小行星正式命名为“南大仙林星”。
院系设置
| 文学院 | 外国语学院 | 哲学系（宗教学系） |
| 历史学系 | 物理学院 | 法学院 |
| 生命科学学院 | 政府管理学院 | 数学系 |
| 天文与空间科学学院 | 地球科学与工程学院 | 马克思主义学院 |
| 信息管理学院 | 社会学院 | 大气科学学院 |
| 地理与海洋科学学院 | 河仁社会慈善学院 | 化学化工学院 |
| 环境学院 | 医学院 | 软件学院 |
| 工程管理学院 | 计算机科学与技术系 | 电子科学与工程学院 |
| 匡亚明学院（基础学科教育学院） | 大学外语部 | 体育部 |
| 现代工程与应用科学学院 | 建筑与城市规划学院 | 海外教育学院 |
| 新闻传播学院 | 创新创业学院 | 商学院 |
| 金陵学院 | 管理学院 |
