福建中医药大学现在有2个校区，分别为福建中医药大学旗山校区、屏山校区。
福建中医药大学原名福建中医学院，创建于1958年，是我国创办较早的高等中医药院校之一，是福建省重点建设高校，2010年3月经教育部批准更名为福建中医药大学。学校设有13个学院（部），2个研究院；有中医学、中西医结合等2个博士学位授权一级学科，17个博士学位授权点。现有全日制在校生1.2万多人，其中研究生1400多人。
1、福建中医药大学旗山校区
地址：福建省福州市闽侯县上街镇上街华佗路1号
2、福建中医药大学屏山校区
地址：五四路282号
学校拥有两个校区，共占地1030亩，各类建筑总面积32万多平方米，教学科研仪器设备总值2.5亿多元，纸质图书120万册、电子图书73万册。学校各类设施优良，配备了现代化的教学、科研、行政、生活等设施，建设了富有中医药文化气息的人文景观，是一个环境优美、文化浓郁的校园，被授予“全国中医药文化建设先进单位”和“全国绿化模范单位”荣誉称号。
