福建中医学院创建于1958年，是我国创办最早的高等中医药院校之一，是福建省中医药教学、科研、医疗中心和我国对外对台中医药合作交流基地和福建省重点建设高校。学校设有9个系(部)、3个二级学院，8所附属医院，25个本科专业及方向；现有2个博士学位授权点、3个一级学科硕士学位授权点、18个硕士学位授权点、8个省局级重点学科、9个国家中医药
管理局重点专病专科，其中硕士授权点涵盖了所有中医学科，本科专业涵盖了医、理、工、管四大学科门类。全校现有各类在校学生近万人。
福建中医学院师资力量雄厚，办学成果丰硕。全校现有教职医护员工2400余人，有博士、硕士生导师300多名。一大批德高望重的学术、学科带头人担任国家级名老中医学术继承人指导老师，获得国家有突出贡献的中青年专家、福建省优秀专家等称号或享受国务院特殊津贴。学校拥有中医基础理论、中医骨伤科学、中西医结合等一批国家、省级重点学科和一批国家、省级重点实验室、医疗中心、临床药理基地等，在中医经络研究、中医骨伤科学基础研究、中西医结合老年病研究、中医证的研究、白内障基础与临床研究、中草药规范化种植与开发利用、中医药信息研究等方面在全国居于领先地位。2002年和2007年，学校在教育部组织的两轮本科教学工作水平评估中，均被评为“优秀”。
福建中医学院还是一所外向型的中医药大学。学校从1988年起招收台湾学生，是全国第一个招收台湾学生的中医药院校。目前，学校是实行对台湾单独招生的高校之一，在校的台港澳学生及外国留学生有400多名，对台教育与交流成为办学特色。学校还与美、德、奥、日、韩、新、马、泰等二十几个国家和台港澳等地区建立了密切合作关系。
福建中医学院环境优美，办学条件优越。学校拥有旗山、屏山两个校区，共占地1096亩，各类建筑面积27万平方米，其中旗山校区是学校办学主体所在地，校内教学、科研设施先进，生活设施齐全。校图书馆是福建省中医药图书文献信息中心。学校注
